Rapsöl ist ein lichtempfindliches Öl, das an einem kühlen und dunklen Platz gelagert werden sollte. Sonnenlicht schadet ihm und lässt es schnell bitter und ranzig werden. Geöffnete Flaschen lagern am besten gut verschlossen im Kühlschrank. Sie sollten jedoch möglichst innerhalb von vier bis sechs Wochen aufgebraucht sein. Rapsöl in original verschlossenen Flaschen hält sich etwa zwölf Monate.